MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008790	GA	3	6	11	16	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008790	AAG	2	6	55	60	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008790	A	7	7	1140	1146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008790	AT	3	6	1157	1162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008790	A	7	7	1166	1172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008790	ATG	2	6	1187	1192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008790	AT	3	6	1212	1217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008790	AAT	3	9	1256	1264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008790	CTA	2	6	1811	1816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008790	TAA	2	6	1823	1828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008790	TAA	2	6	1840	1845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008790	AT	4	8	1852	1859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008790	TAAT	2	8	1860	1867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008790	TTAAT	3	15	1863	1877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008790	TAA	2	6	1880	1885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008790	ATA	2	6	1886	1891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008790	TA	3	6	1893	1898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008790	TA	4	8	1901	1908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008790	GAG	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008790	TTA	2	6	3674	3679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008790	TA	3	6	3691	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008790	A	6	6	3714	3719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008790	T	7	7	3722	3728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008790	A	6	6	4579	4584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008790	CTTT	2	8	11141	11148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008790	T	6	6	13136	13141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008790	ATT	2	6	13188	13193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008790	ATT	2	6	13196	13201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008790	ATT	2	6	13222	13227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008790	ACT	2	6	13248	13253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008790	TAA	2	6	13257	13262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008790	A	6	6	14878	14883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008790	CTA	2	6	14920	14925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008790	ATA	2	6	16240	16245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008790	TA	3	6	16244	16249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008790	A	6	6	16249	16254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008790	T	6	6	16257	16262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008790	AT	3	6	16263	16268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008790	TAA	2	6	16276	16281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008790	TAT	2	6	16287	16292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008790	A	7	7	16310	16316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008790	ACA	2	6	16624	16629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008790	TTG	2	6	16632	16637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008790	TAT	2	6	16696	16701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008790	AT	3	6	16700	16705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008790	AT	3	6	16718	16723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008790	TAAT	2	8	16739	16746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008790	CTT	2	6	17082	17087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008790	ATT	2	6	17314	17319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008790	ATT	2	6	17335	17340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008790	TAA	2	6	17380	17385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008790	TTG	2	6	17389	17394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008790	A	6	6	17438	17443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008790	ATTT	2	8	17489	17496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008790	T	6	6	17539	17544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008790	ATGA	2	8	19795	19802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008790	AAAGAC	2	12	19814	19825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008790	TTTTA	2	10	19849	19858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008790	T	6	6	19867	19872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008790	TCA	2	6	21209	21214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008790	A	6	6	21235	21240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008790	TAAA	2	8	21252	21259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008790	AAT	2	6	21268	21273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008790	TTAAT	2	10	21275	21284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008790	ATTTA	2	10	21296	21305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008790	TTA	2	6	21307	21312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008790	ATAA	2	8	21329	21336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008790	T	6	6	21346	21351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008790	CAA	2	6	25664	25669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008790	GA	3	6	34471	34476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008790	TA	3	6	36055	36060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008790	A	7	7	36062	36068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008790	A	6	6	36072	36077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008790	A	6	6	36092	36097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008790	TTA	3	9	36769	36777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008790	TTA	2	6	36779	36784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008790	T	6	6	36817	36822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008790	AGT	2	6	36832	36837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008790	A	6	6	36843	36848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008790	A	7	7	36873	36879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008790	TAA	2	6	36912	36917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008790	TA	3	6	36918	36923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008790	TAA	2	6	36928	36933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008790	TAT	2	6	36935	36940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008790	TAA	2	6	36955	36960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008790	ATAAG	2	10	36972	36981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008790	TAA	2	6	39195	39200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008790	ATTT	2	8	39207	39214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008790	TAAT	2	8	39215	39222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008790	TAA	2	6	39225	39230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008790	ATA	2	6	39231	39236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008790	T	6	6	39276	39281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008790	GAG	2	6	39284	39289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008790	TAT	2	6	41004	41009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008790	TAA	2	6	41019	41024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008790	TAAA	2	8	41044	41051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008790	T	6	6	41115	41120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008790	T	6	6	41245	41250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008790	GAA	2	6	41263	41268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008790	ATG	2	6	43246	43251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008790	TAA	2	6	43296	43301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008790	AGGA	2	8	43306	43313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008790	AAGA	2	8	43358	43365	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008790	TCA	2	6	43397	43402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008790	ATC	2	6	43456	43461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008790	A	8	8	43504	43511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008790	GGGT	2	8	43520	43527	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008790	TGA	2	6	43807	43812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008790	CAGG	2	8	43884	43891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008790	TAC	2	6	43932	43937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.